И в то время как внутри двигатель объемом 998 кубиков остался неизменным, все та же рядная четверка с перекрестным валом, которая дебютировала в модели 2009 года, инженеры компании теперь добавили систему traction control на семь уровней, плюс трехпозиционная система Drive Mode, итого 21 вид настроек.
Снаружи же был проведен очень тонкий, практически незаметный глазу редизайн.
Для запуска R1 образца 2012 года в нестандартной юбилейной облицовке 50th Special Edition Anniversary компания Yamaha Europe подготовила серию рекламных фотографий и видео с участием пилота команды Yamaha в серии MotoGP американца Бена Спиза (Ben Spies).
И тот справился с задачей на отлично, постаравшись создать образ лучшего мотоцикла всех времен и народов. В рекламе также мелькают и другие пилоты, демонстрирующие класс на обновленном мотоцикле R1.
Мотоциклы в исполнении 50th Special Edition Anniversary будут выпущены ограниченным тиражом всего в 2000 экземпляров и будут продаваться не во всех странах.